狄仁杰(梁冠華 飾)回朝后卻發(fā)現(xiàn)文武百官都在殿外，他上前一問才知道原來陛下已經幾日未上朝，她給自己下了一道罪己詔，之后便把自己關在上陽宮里，不許任何人打擾，就連張柬之(郭政建 飾)都無法進去?，F(xiàn)朝中的大小事務均由武三思(張冰 飾)和武懿宗(卓凡 飾)二位大人處理，他們自說是陛下降旨，由他們總領武成殿，代行朝政，可文武百官均無一人見過敕書，對此深感懷疑。

張柬之現(xiàn)已經帶著加急奏折進殿去，他試圖游說兩位大人讓他面圣，狄仁杰知曉了事情的原委便也打算進殿查看。武成殿內，張柬之想要面圣卻遭遇到武三思和武懿宗兩人的阻止。這時狄仁杰也到了殿里，狄仁杰向武三思和武懿宗兩人說明了他要圣的緣由和其中道理，可兩人還是依舊不肯讓狄仁杰面圣，狄仁杰自知不可硬來也只好離開了武成殿。

三日后，張柬之從密道來到了狄府。狄仁杰將自己的想法告訴了張柬之，他猜想上陽宮可能出事了，武皇雖也曾閉關自省過，但從未有一次像現(xiàn)在這樣一連數(shù)日，還委托他人代理朝綱，他們現(xiàn)在的當務之急是需要潛入上陽宮，摸清上陽宮內究竟發(fā)生了何事。

夜晚，元芳來到上陽宮里想偷偷潛入查看，不料上陽宮里除了他還有另一神秘黑衣人，兩人在宮內相互交起手來，結果卻驚動了宮中的侍衛(wèi)，神秘黑衣人和元芳各自解決掉身旁的侍衛(wèi)便一起逃離了現(xiàn)場，神秘黑衣人摘掉了自己的面具并想讓元芳將他引薦給狄仁杰，元芳不知他的身份有些遲疑，生怕他是敵非友，直到黑衣人提出了上陽宮的事情，元芳這才決定帶他前往狄府。

狄府內，元芳將黑衣人帶到了狄仁杰面前。狄仁杰看過黑衣人所使用的武器便知曉了他是當今國師弘毅(王建新 飾)。弘毅向狄仁杰表明此次來意，他有一患者身中劇毒，可他卻無計可解，他得知狄仁杰擅長解毒因此便在上陽宮里等候元芳，然后再讓元芳引薦他到狄府。狄仁杰對此患者身份深感好奇，但國師只道他見了患者一切自會明了。

上陽宮的變故，國師的造訪令狄仁杰不得不審思萬端，事態(tài)的發(fā)展正如他所料，暗相響應，前后接踵，不期而然地發(fā)生著，可究竟武皇是遭遇了什么不測他卻一無所知，為了探清這一切狄仁杰當下便決定立即隨弘毅前去查看病人。待弘毅走出房間后，元芳也將自己的收獲告訴了狄仁杰，上陽宮里憑空出現(xiàn)了一棵青銅樹，情形甚是詭異。狄仁杰聽此便馬上手寫一封信，讓狄春(楊常青 飾)連夜送給張柬之。

國師不肯透露患者的住處，而且還要求狄仁杰與元芳兩人蒙上眼睛，然后將兩人帶往一處府邸。狄仁杰在府邸內看著面前出現(xiàn)的老婦便直接喚了一聲公主。原來，面前的這位老婦竟然是當今的公主殿下，太平公主(朱銳 飾)。公主卸下了自己的面具并好奇于狄仁杰是如何知曉她的身份。狄仁杰只道他在車上雖然雙目被蒙，但周圍的感覺并沒有被蒙住，他深知公主的府邸和自己府邸的距離，再加上剛他一踏進房間便聞到老婦身上有一股龍涎香，龍涎香除了當今圣上也只有公主殿下能用得起并且敢用。

狄仁杰再三向公主保證了自己與元芳兩人絕對不會對此事泄露半點風聲，公主這才帶著狄仁杰來到一密室中查探病人。狄仁杰看到面前的病人大感詫異，眼前的人居然是武皇，他為武皇把脈過后確定了這是中毒的跡象，于是當下便用針灸將武皇身上的毒素逼出并開一副藥方延緩毒素的蔓延。

公主將這一切事情的緣由告訴了狄仁杰。幾日前，宮內士兵一直在傳言鬧鬼，上陽宮前有異常，于是武皇便親自前往那棵憑空冒出的青桐樹查看?？晌浠士拷榭磿r卻暈倒了，宮內太醫(yī)都診斷出武皇這是身中劇毒卻無一人可解。為了確保武皇的安全她當時便馬上命人將武皇連夜送回太平府，而就在她命人將武皇送走后，武三思和武懿宗兩人也來到了皇宮，他們兩人一進宮便馬上在尋找武皇，幸虧她巧用移花接木之術這才讓武皇逃過一劫。

武三思和武懿宗尋不到武皇便直接宣布起他們要代理朝綱一事，并將當晚在場所有人都關押殿內不得走露半點風聲，她雖然心有不滿可也無可奈何，只能回府找國師前來救治武皇。國師查看過武皇后也毫無辦法，這才向她推薦起了狄仁杰，所以才有了之后的事情。

狄仁杰明白了這一切后便問公主是否有看過那棵青銅樹，公主只道她當時心系著武皇并未到上陽宮查看過。這時，國師也將煎好的藥和自己從西域帶來的解毒奇藥送了過來，狄仁杰讓武皇先服過自己所開的藥并問起了宮中太醫(yī)所開的藥方是否有留底，公主聽完后便馬上將她抄寫的那份藥方遞給了狄仁杰查看。